清代著名医家王孟英对温病学的发展做出了重大贡献，善治内外科疑难杂病，王孟英认为痔疮是伏邪所致，伏邪往往会在气候更迭时候发生，比如初秋时节、盛夏余热未消，气温仍时有上升，加之秋雨绵绵湿气较重，这个时候潜伏在人体里面的邪气就会表现在人体的皮肤上。
祖医治痔堂传承了著名医家王孟英的中医理论，认为痔疮的发生是人体伏邪气淤所致，首先需要用祖医治痔堂的秘方散除人体的邪气和湿气，祖医治痔堂归纳了《王孟英医案》中众多治疗疑难杂症案例的用药特点，通过太祖到嫡孙四代人的共同努力，通过中医外用内服相配合的治疗方式。
古代对痔疮治疗多主张：清热解毒，凉血祛瘀。宋?窦汉卿在《疮疡经验全书》中说：“以一诸痔，各类不同……大半以凉血为主，徐徐取效。”元?朱震亨主张“痔疮专以凉血为主”(《丹溪心法》)。刘元素谓：“当泻三焦，火热退，使金得气而反制木，木受制则五虫不生，痔有愈矣”(《河间医学?痔论》)。东垣、子和亦认为有火、有热，主以凉血清热，除湿化瘀。这些治法在临床中，疗效确切。但临床上有因风、湿、燥、热而病者；有气血两亏，脾、肺、肾虚而病者；有虚实夹杂者。所以在治疗上就应随证施治，既要扶正，又要祛邪。按其病因病机辨证分为以下几个类型：
(1)风伤肠络
主证：便血色鲜红，滴血或射血，或有肛门瘙痒，口燥咽干。舌质红，苔薄白或薄黄，脉浮数。
治法：清热凉血祛风。
代表药品：痔根断片、消痔灵注射液、鳖甲消痔胶囊、化痔灵片、强力痔根断片、三七化痔丸、痔舒适洗液、马应龙麝香痔疮栓、普济痔疮栓
(2)湿热下注
主证：便血色鲜红，量较多，肛内肿物外脱，可自行回缩，或脱出物渗出液较多，黏膜糜烂，或伴大便黏滞不爽，肛门灼热，潮湿不适。舌质红，苔黄腻，脉濡数或滑数。
治法：清热渗湿止血。
代表药品：消痔软膏、牛黄痔清栓、痔痛安搽剂、熊胆痔疮膏、马应龙麝香痔疮膏、金玄痔科熏洗散、肤痔清软膏、肛泰栓、化痔栓（一般都是外用药）
(3)气滞血瘀
主证：肛缘肿胀，隐见紫瘀，内痔脱出，表面紫暗糜烂，疼痛剧烈，肛管紧缩，便秘溲黄。舌质紫暗或有瘀斑，苔白或黄，脉弦或涩。
治法：行气化瘀，消肿解毒止痛。
代表药品：痔速宁片、云南白药痔疮膏、九华痔疮栓
(4)脾虚气陷
主证：痔核脱出，不易复位，肛门下坠感，便血色淡，伴气短懒言，纳呆便溏，神疲乏力，面色无华。舌质淡，苔薄白，脉细弱或芤。
治法：补中益气，固脱止血。
代表药品：补中益气丸（一般和其他四类的药物配合用药，以补为主）
(5)阴虚肠燥
主证：便血色鲜红，量少，大便干结难解，形体瘦弱或伴口咽干燥，潮热盗汗。舌质红，苔薄，脉细数。
治法：滋阴清热润肠。
代表药品：痔炎消颗粒、痔炎消片
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